人类肿瘤个体化治疗的原则

发布日期:2017-11-02

分子诊断与肿瘤个体化治疗原则,它们决定了包括身高、体重、发色、眼睛颜色和肤色在内的各种表型。更重要的是,这些SNP可能是对环境暴露和药物治疗,产生不同响应程度的原因所在。与此同时,GWAS已经识别了数千种疾病易感位点,而在即将开展的测序研究中,仍有许多位点有待识别,它们是个性化风险评估中疾病预防和个性化药物治所在,会对人类的病程和预期寿命产生显著影响。

然而,人类SNP的规模和复杂性及其在疾病诊断、治疗和预防中的可能性,直到人类基因组项目完成后才得到充分认识和理解。针对常见病,科学家发明了SNP芯片,让人可以研究多达数百万种SNP的基因型,研究人员开始集中精力,开展针对包括癌症在内的各种疾病的全基因组关联研究,其中预期将鉴别造成常见病的等位基因或突变,同时用于识别具有高患病风险的人群。


截至2011年6月,在237种特性研究中,已经识别了常见突变的1449种全基因组关联。根据这些数据,如果位于非同义部位、启动区,关联强度优势比(oddsratio)>2的那些SNP,是潜在有功能性的。尽管如此,GWAS已经漏掉了许多最可能具有功能性的未知的罕见变体。

随着直接测序价格的日益降低、和测序技术的普及,此类罕见的突变体,有可能在未来几年中针对这些特征得到识别。人类基因组计划揭示了SNP,是基因组中最常见的遗传变异,发生概率约为每1200bP—次。因此,人类基因组中有超过1000万种SNP,随着千人基因组计划的完成,这一数字可能增加至甚至超过1500万。

出国看病找爱诺美康,治疗的潜在目标,目前所面临的挑战在于、继续从人类患病风险的更多研究中,识别尚未报道的致病SNP。SNP信息的汇集对于GWAS的后关联和基因研究、人群遗传学和生物信息学研究、进化和系统生物学研究,以及定位克隆和物理图谱项目来说、都具有非常重要的意义。

目前科学界已经开发了多个SNP数据库,其中包括美国国家生物技术信息中心(NCBI)的dbSNP数据库、多来源性的SNPedia数据库、多态性和疾病相关性的0MIM数 据库,提供导致人类遗传性疾病或与其相关的基因突变,功能性SNP的人类基因突变数据库,以及整合和比较查询GWAS数据集的GWAS中心数据库是最常用的,其中多数SNP已经在HapMap数据库中以SNP频率、基因型和单倍型的形式得到了验证,可以通过广泛使用的Haploview工具进行访问。

HapMap还包含一个基因组浏览器,可以在数据库里找到所关注的SNP。SNPInfo是基于网络的SNP选择工具,研究人员可以根据GWAS的结果及编码和非编码SNP的预期功能性特性,利用它明确基因或连锁区,并选择SNP进行进一步的功能性验证。