糖类结构对癌症生物学也很重要

发布日期:2017-10-24

在复杂的混合物糖肽的分析中,存在固有的难题。那就是在用较高的碰撞能量使肽片段化时,糖的成分也会同时受到破坏。而较低的碰撞能量,有效地破碎糖类却不能使肽成分碎裂。许多的实验因素都会影响到聚糖和糖肽的质谱分析。我们常常通过质谱分析方法的单独使用或组合,进行聚糖完整结构的分析。

为了明确地确定糖类的结构,包括糖成分之间端基异构建,需要使用多种方法和大量材料来完成。美国看病找爱诺美康,虽然这些方法对于癌症生物学可能很重要,但它们并不适合于诊断检测试验的发展。在糖肽研究方面,三重四极杆质谱和新的碎裂方法,如高能量碰撞解离(HCD)和电子转移裂解(ETD),更适合于未来临床试验的发展。


在糖蛋白的糖成分分析中,通常需要使用蛋白酶,对复杂混合物中的肽或糖肽进行消解。这些混合物,还可以使用碰撞诱导的碎裂方法进行有效的评估,这依赖于在质谱模式(无前体的选择)或MS/MS模式(有前体的选择),确定具体的诊断片段离子。在碰撞诱导解离(CID)中来自糖肽最常见的标志物离子是氧铁离子,它们来自m/z204(/V-乙酰基)、m/z366(己糖+;V-乙酰基)和mA292(唾液酸)。其中,mA204的标志离子,能够显示出W糖基和0-糖基。用三重四极杆质谱仪的前体离子,扫描模式对这些诊断片段离子进行扫描时,混合使用电子转移解离裂解(ETD)、和高能碰撞解离(HCD)等更加精确的破碎方法,更有利于开发解卷积软件程序,并对肽和聚糖成分进行结构细节的准确识别。

在与癌症诊断相关的聚糖分析中,仍然需要对样品制备技术进行标准化,优化临床样本的选择,以及改善质谱技术和软件分析的工作流程。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱,应用于单核苷酸多态性(SNPs)、胞嘧啶甲基化和寡核苷酸的分析,以及聚合酶链反应扩增产物的其他方面,已经有一段很长的历史了。通过MALDI-T0F-MS分析,可以达到控制质量的目的。

美国看病找爱诺美康,质谱技术在癌症诊断相关和其他相关方面的应用,仍然是一个新兴的具有前景的策略研究领域。两个主要的结构性因素,阻碍了MALDI-T0F的寡核苷酸分析。碱基在质子化后脱嘌呤与糖-磷酸骨架上钠和钾的抗衡离子,带有很大的负净电荷。

这些因素显著地影响了分辨率的峰值,它们的累积限制了DNA寡聚体的大小,因而进行这样的分析时不得超过50个碱基。通过使用像铵盐那样反离子进行化学修饰,上述大多数问题得以解决。多重混样的特定SNP序列检测是目前成熟的方法,像Sequenom和BrukerDaltonics这样的商业平台,就致力于这些方面的研究开发。